Polsko-Słowacka Komisja Nauk Humanistycznych przy Ministerstwie Edukacji i Nauki Rzeczpospolitej Polskiej i Ministerstwie Szkolnictwa, Badań, Rozwoju i Młodzieży Republiki Słowackiej powołana została w oparciu o ogólne zapisy umowy międzyrządowej o współpracy kulturalnej i naukowej pomiędzy obu krajami z dnia 10 września 1991 roku oraz Porozumienie o współpracy między Ministerstwem Edukacji Narodowej RP i Ministerstwem Szkolnictwa RS na lata 1995-1998 z dnia 16 czerwca 1995 roku. Statut Komisji został przyjęty w dniu 9 września 1997 roku.
Dohodu z roku 1991 nahradila dohoda zo dňa 23. marca 2000. Ustanovenia týkajúce sa komisie boli zahrnuté do Programu spolupráce medzi Ministerstvom národného vzdelávania a športu PR a Ministerstvom školstva SR na roky 2003 - 2006 (vypracovaný 20. decembra 2002), ktorý sa automaticky predlžuje na ďalšie roky.
Medzi najvýznamnejšie úlohy komisie patrí rozvoj poľsko-slovenskej spolupráce, vedecký výskum v oblasti vzťahov Slovenska a Poľska. Komisia každoročne organizuje zasadnutia, ktorých súčasťou sú vedecké konferencie za účasti odborníkov z oblasti poľsko-slovenských vzťahov. Zastúpené sú najmä tieto disciplíny: jazykoveda, literárna veda, dejiny, religionistika, kulturológia, etnológia a kultúrna antropológia.
Výsledky práce komisie sú publikované v časopise Kontakty, vedeckých zborníkoch a monografiách.